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解決済みの質問

pcr法について

以下の2つのプライマーを使用してある鋳型DNAをpcr法で複製するのですが、最終的に鋳型DNAのどの塩基配列が大量に複製されるのかがわかりません。どなたかお詳しい方がいらっしゃいましたら教えていただきたいです。よろしくお願い致します。
プライマー1:5’-GATTGAGCCAGTCAGAGGATAAGTC-3’
プライマー2:5'-AGGTTGAGTTCTCGCATTTGTGCCG-3

投稿日時 - 2018-06-07 22:21:25

QNo.9506118

困ってます

質問者が選んだベストアンサー

ある鋳型と書いているので、鋳型DNAの由来は分かっているが、使用するプライマーでどの範囲が増幅されるのかがわからないという事でしょうか。
つまり、このプライマーが標的とする遺伝子またはオペロンが何かわからずにPCRしようとしていると・・・。
本題から外れちゃいますけれど、実験の目的を指導担当(先生でしょうか?)にまずは確認した方が良いと思いますね。
それで、本題ですが鋳型DNAの配列が分かっているなら、プライマーの配列をPC上でアライメントしてアニールする場所を見つければすぐにわかりますよ。
鋳型の配列が解読されていないなら、相同性検索をするとかかな。プライマーマッチングのソフトもネット上にあるので、そこにアップして検索してもいいとおもいます。荒技ですけど、プライマーの配列をそのままググって、論文がヒットすれば標的遺伝子がわかることもありますよ。

投稿日時 - 2018-06-09 11:35:20

お礼

お返事が遅くなってしまい申し訳ありません。
実験担当教員に確認したところ、無事理解することができました。
様々な方法を教えていただき、感謝しております。今後の学習の参考にさせていただきたいです!
ご丁寧な回答ありがとうございました。

投稿日時 - 2018-06-11 22:46:12

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回答(1)

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